عملت وزارة الأوقاف والدعوة والإرشاد على إعادة ترميمه، إذ انتهت مرحلة توسيع الحرم الرئيس، وفُتحت الأقواس التي كانت مغلقة، وجُهزت قبة جديدة للمسجد، وبني مصلى للنساء، كما جُهزت ميضأة خاصة بالنساء منفصلة عن ميضأة الرجال، وعملت الوزارة على توسعة ساحة المسجد، فعثر على العديد من القطع الأثرية القيمة، ووضعت ضمن المسجد للحفاظ عليها.